Characterization of Globin RNA Interference in Gene Expression Profiling of Whole-Blood Samples April 19, 2008

Penemuan biomarker darah berdasarkan profil ekspresi gen telah dirintangi oleh interferensi dari endogen dengan α dan β globin transkrip yang berlimpah. Dalam jurnal ini peneliti memberikan gambaran mengenai cara untuk mengukur interferensi dari globin transkrip dengan memaparkan dan mengkarakterisasi globin interference, memproduksi globin interference dengan transkrip sintesis, dan menggunakan kurva ROC untuk mengukur sensitifitas dan spesifisitas dari susunan perpindahan  α dan β globin traskrip.

Metode yang digunakan dalam penelitian ini, peneliti menggunakan 2 sampel darah dan mengekstraksi RNA total dalam tube PreAnalitix Paxgene. Sebagai referensi untuk mengkarakteristikan interference, peneliti menambahkan aliquot RNA total dengan sintesis globin transkrip dan RNA total dari otak manusia. Seleksi aliquot tersebut diproses dengan Ambion Globin. Semua aliquot dihibridisasi dengan Agilent DNA microarray yang merupakan desain pengumpulan skema untuk mengukur mitigasi globin interference dan menetapkan tanda-tanda ekspresi gen.

Langkah-langkah diatas digunakan untuk membandingkan data microarray antara sample yang menunjukkan bahwa mitigasinya dapat menurunkan tanda interference dari lebih 1000 gen menjadi kira-kira 200.

Kesimpulan dari penelitian ini, peneliti menetapkan bahwa kedua sample tersebut merupakan konsentrasi absolute dari globin transkrip dan perbedaan dalam konsentrasi transkrip tanpa sample set merupakan faktor penyebab globin interference.

Nama       : Dea Inriasari NIM         : O1A005061 Email        : dee_moet5@yahoo.com          Blog         : deemoet.wordpress.com

Hello world! Maret 3, 2008

Welcome to WordPress.com. This is your first post. Edit or delete it and start blogging!